mirror of
https://github.com/BioArchLinux/Packages.git
synced 2025-03-10 12:02:42 +00:00
r-*: refresh depends and opt depends
This commit is contained in:
sukanka
kbipinkumar
parent
12dc3c4855
commit
3f2e9dfd76
70 changed files with 159 additions and 142 deletions
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@ -4,7 +4,7 @@ _pkgname=ade4
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_pkgver=1.7-20
|
||||
pkgname=r-${_pkgname,,}
|
||||
pkgver=1.7.20
|
||||
pkgrel=1
|
||||
pkgrel=2
|
||||
pkgdesc='Analysis of Ecological Data: Exploratory and Euclidean Methods in Environmental Sciences'
|
||||
arch=('x86_64')
|
||||
url="https://cran.r-project.org/package=${_pkgname}"
|
||||
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@ -12,6 +12,8 @@ license=('GPL')
|
|||
depends=(
|
||||
r
|
||||
r-pixmap
|
||||
r-rcpp
|
||||
r-rcpparmadillo
|
||||
r-sp
|
||||
)
|
||||
optdepends=(
|
||||
|
|
|
|||
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@ -4,6 +4,8 @@ maintainers:
|
|||
email: kuoi@bioarchlinux.org
|
||||
repo_depends:
|
||||
- r-pixmap
|
||||
- r-rcpp
|
||||
- r-rcpparmadillo
|
||||
- r-sp
|
||||
update_on:
|
||||
- regex: ade4_([\d._-]+).tar.gz
|
||||
|
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|||
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@ -4,14 +4,13 @@ _pkgname=bioCancer
|
|||
_pkgver=1.26.04
|
||||
pkgname=r-${_pkgname,,}
|
||||
pkgver=1.26.04
|
||||
pkgrel=1
|
||||
pkgrel=2
|
||||
pkgdesc='Interactive Multi-Omics Cancers Data Visualization and Analysis'
|
||||
arch=('any')
|
||||
url="https://bioconductor.org/packages/${_pkgname}"
|
||||
license=('AGPL')
|
||||
depends=(
|
||||
r
|
||||
r-algdesign
|
||||
r-annotationdbi
|
||||
r-biobase
|
||||
r-clusterprofiler
|
||||
|
|
@ -20,20 +19,15 @@ depends=(
|
|||
r-dplyr
|
||||
r-dt
|
||||
r-genetclassifier
|
||||
r-go.db
|
||||
r-htmlwidgets
|
||||
r-httr
|
||||
r-import
|
||||
r-org.bt.eg.db
|
||||
r-org.hs.eg.db
|
||||
r-plyr
|
||||
r-r.methodss3
|
||||
r-r.oo
|
||||
r-radiant.data
|
||||
r-reactome.db
|
||||
r-reactomepa
|
||||
r-shiny
|
||||
r-shinythemes
|
||||
r-tibble
|
||||
r-visnetwork
|
||||
r-xml
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -3,7 +3,6 @@ maintainers:
|
|||
- github: starsareintherose
|
||||
email: kuoi@bioarchlinux.org
|
||||
repo_depends:
|
||||
- r-algdesign
|
||||
- r-annotationdbi
|
||||
- r-biobase
|
||||
- r-clusterprofiler
|
||||
|
|
@ -12,20 +11,15 @@ repo_depends:
|
|||
- r-dplyr
|
||||
- r-dt
|
||||
- r-genetclassifier
|
||||
- r-go.db
|
||||
- r-htmlwidgets
|
||||
- r-httr
|
||||
- r-import
|
||||
- r-org.bt.eg.db
|
||||
- r-org.hs.eg.db
|
||||
- r-plyr
|
||||
- r-r.methodss3
|
||||
- r-r.oo
|
||||
- r-radiant.data
|
||||
- r-reactome.db
|
||||
- r-reactomepa
|
||||
- r-shiny
|
||||
- r-shinythemes
|
||||
- r-tibble
|
||||
- r-visnetwork
|
||||
- r-xml
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -4,7 +4,7 @@ _pkgname=BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38
|
|||
_pkgver=1.4.5
|
||||
pkgname=r-${_pkgname,,}
|
||||
pkgver=1.4.5
|
||||
pkgrel=1
|
||||
pkgrel=2
|
||||
pkgdesc='Full genome sequences for Homo sapiens (UCSC version hg38, based on GRCh38.p13)'
|
||||
arch=('any')
|
||||
url="https://bioconductor.org/packages/${_pkgname}"
|
||||
|
|
@ -12,6 +12,7 @@ license=('Artistic2.0')
|
|||
depends=(
|
||||
r
|
||||
r-bsgenome
|
||||
r-genomeinfodb
|
||||
)
|
||||
source=("https://bioconductor.org/packages/release/data/annotation/src/contrib/${_pkgname}_${_pkgver}.tar.gz")
|
||||
sha256sums=('b49277e4fd955be76571f187630993b02a459c7c5b69ef62a01a75dd5226e952')
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -4,6 +4,7 @@ maintainers:
|
|||
email: kuoi@bioarchlinux.org
|
||||
repo_depends:
|
||||
- r-bsgenome
|
||||
- r-genomeinfodb
|
||||
update_on:
|
||||
- regex: BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38_([\d._-]+).tar.gz
|
||||
source: regex
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -4,7 +4,7 @@ _pkgname=C50
|
|||
_pkgver=0.1.8
|
||||
pkgname=r-${_pkgname,,}
|
||||
pkgver=0.1.8
|
||||
pkgrel=1
|
||||
pkgrel=2
|
||||
pkgdesc='C5.0 Decision Trees and Rule-Based Models'
|
||||
arch=('x86_64')
|
||||
url="https://cran.r-project.org/package=${_pkgname}"
|
||||
|
|
@ -19,6 +19,7 @@ optdepends=(
|
|||
r-knitr
|
||||
r-modeldata
|
||||
r-rmarkdown
|
||||
r-testthat
|
||||
)
|
||||
source=("https://cran.r-project.org/src/contrib/${_pkgname}_${_pkgver}.tar.gz")
|
||||
sha256sums=('bbd1bd5ed0ed5257529396697bea2a5841c8159470ba09d2066411d4aeda9c15')
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -4,7 +4,7 @@ _pkgname=caretEnsemble
|
|||
_pkgver=2.0.2
|
||||
pkgname=r-${_pkgname,,}
|
||||
pkgver=2.0.2
|
||||
pkgrel=1
|
||||
pkgrel=2
|
||||
pkgdesc='Ensembles of Caret Models'
|
||||
arch=('any')
|
||||
url="https://cran.r-project.org/package=${_pkgname}"
|
||||
|
|
@ -36,7 +36,9 @@ optdepends=(
|
|||
r-randomforest
|
||||
r-rmarkdown
|
||||
r-rpart
|
||||
r-sass
|
||||
r-testthat
|
||||
r-usethis
|
||||
)
|
||||
source=("https://cran.r-project.org/src/contrib/${_pkgname}_${_pkgver}.tar.gz")
|
||||
sha256sums=('d8fcf3742beddc723b68677682708408cc11dcb8b36a0f70f03e7c4763e04f4d')
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -5,19 +5,23 @@ _pkgname=CeTF
|
|||
_pkgver=1.10.2
|
||||
pkgname=r-${_pkgname,,}
|
||||
pkgver=1.10.2
|
||||
pkgrel=1
|
||||
pkgrel=2
|
||||
pkgdesc='Coexpression for Transcription Factors using Regulatory Impact Factors and Partial Correlation and Information Theory analysis'
|
||||
arch=('x86_64')
|
||||
url="https://bioconductor.org/packages/${_pkgname}"
|
||||
license=('GPL')
|
||||
depends=(
|
||||
curl
|
||||
gcc-fortran
|
||||
libxml2
|
||||
openssl
|
||||
r
|
||||
zlib
|
||||
r-circlize
|
||||
r-clusterprofiler
|
||||
r-complexheatmap
|
||||
r-deseq2
|
||||
r-dplyr
|
||||
r-genomictools
|
||||
r-genomictools.filehandler
|
||||
r-ggally
|
||||
r-ggnetwork
|
||||
|
|
@ -31,11 +35,6 @@ depends=(
|
|||
r-rcy3
|
||||
r-s4vectors
|
||||
r-summarizedexperiment
|
||||
libxml2
|
||||
gcc-fortran
|
||||
curl
|
||||
openssl
|
||||
zlib
|
||||
)
|
||||
optdepends=(
|
||||
r-airway
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -8,7 +8,6 @@ repo_depends:
|
|||
- r-complexheatmap
|
||||
- r-deseq2
|
||||
- r-dplyr
|
||||
- r-genomictools
|
||||
- r-genomictools.filehandler
|
||||
- r-ggally
|
||||
- r-ggnetwork
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -5,7 +5,7 @@ _pkgname=ClusterR
|
|||
_pkgver=1.3.0
|
||||
pkgname=r-${_pkgname,,}
|
||||
pkgver=1.3.0
|
||||
pkgrel=1
|
||||
pkgrel=2
|
||||
pkgdesc='Gaussian Mixture Models, K-Means, Mini-Batch-Kmeans, K-Medoids and Affinity Propagation Clustering'
|
||||
arch=('x86_64')
|
||||
url="https://cran.r-project.org/package=${_pkgname}"
|
||||
|
|
@ -15,7 +15,6 @@ depends=(
|
|||
r
|
||||
r-ggplot2
|
||||
r-gmp
|
||||
r-gtools
|
||||
r-lifecycle
|
||||
r-rcpp
|
||||
r-rcpparmadillo
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -5,7 +5,6 @@ maintainers:
|
|||
repo_depends:
|
||||
- r-ggplot2
|
||||
- r-gmp
|
||||
- r-gtools
|
||||
- r-lifecycle
|
||||
- r-rcpp
|
||||
- r-rcpparmadillo
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -4,7 +4,7 @@ _pkgname=Cubist
|
|||
_pkgver=0.4.2
|
||||
pkgname=r-${_pkgname,,}
|
||||
pkgver=0.4.2
|
||||
pkgrel=1
|
||||
pkgrel=2
|
||||
pkgdesc='Rule- And Instance-Based Regression Modeling'
|
||||
arch=('x86_64')
|
||||
url="https://cran.r-project.org/package=${_pkgname}"
|
||||
|
|
@ -14,12 +14,14 @@ depends=(
|
|||
r-reshape2
|
||||
)
|
||||
optdepends=(
|
||||
r-covr
|
||||
r-dplyr
|
||||
r-knitr
|
||||
r-mlbench
|
||||
r-modeldata
|
||||
r-rlang
|
||||
r-rmarkdown
|
||||
r-testthat
|
||||
r-tidyrules
|
||||
)
|
||||
source=("https://cran.r-project.org/src/contrib/${_pkgname}_${_pkgver}.tar.gz")
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -4,7 +4,7 @@ _pkgname=dockerfiler
|
|||
_pkgver=0.2.1
|
||||
pkgname=r-${_pkgname,,}
|
||||
pkgver=0.2.1
|
||||
pkgrel=1
|
||||
pkgrel=2
|
||||
pkgdesc='Easy Dockerfile Creation from R'
|
||||
arch=('any')
|
||||
url="https://cran.r-project.org/package=${_pkgname}"
|
||||
|
|
@ -28,6 +28,7 @@ optdepends=(
|
|||
r-knitr
|
||||
r-rmarkdown
|
||||
r-testthat
|
||||
r-withr
|
||||
)
|
||||
source=("https://cran.r-project.org/src/contrib/${_pkgname}_${_pkgver}.tar.gz")
|
||||
sha256sums=('77cbbb05265b22c7fdd5fba06caf294fc3f02c4f92faefa3102f57d9c6a9bd5a')
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -4,7 +4,7 @@ _pkgname=doRNG
|
|||
_pkgver=1.8.6
|
||||
pkgname=r-${_pkgname,,}
|
||||
pkgver=1.8.6
|
||||
pkgrel=1
|
||||
pkgrel=2
|
||||
pkgdesc="Generic Reproducible Parallel Backend for 'foreach' Loops"
|
||||
arch=('any')
|
||||
url="https://cran.r-project.org/package=${_pkgname}"
|
||||
|
|
@ -16,13 +16,15 @@ depends=(
|
|||
r-rngtools
|
||||
)
|
||||
optdepends=(
|
||||
r-bibtex
|
||||
r-covr
|
||||
r-devtools
|
||||
r-dompi
|
||||
r-doparallel
|
||||
r-doredis
|
||||
r-knitr
|
||||
r-pkgmaker
|
||||
r-rbenchmark
|
||||
r-rbibutils
|
||||
r-testthat
|
||||
)
|
||||
source=("https://cran.r-project.org/src/contrib/${_pkgname}_${_pkgver}.tar.gz")
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -4,13 +4,14 @@ _pkgname=dplyr
|
|||
_pkgver=1.1.0
|
||||
pkgname=r-${_pkgname,,}
|
||||
pkgver=1.1.0
|
||||
pkgrel=1
|
||||
pkgrel=2
|
||||
pkgdesc='A Grammar of Data Manipulation'
|
||||
arch=('x86_64')
|
||||
url="https://cran.r-project.org/package=${_pkgname}"
|
||||
license=('MIT')
|
||||
depends=(
|
||||
r
|
||||
r-cli
|
||||
r-generics
|
||||
r-glue
|
||||
r-lifecycle
|
||||
|
|
@ -40,6 +41,7 @@ optdepends=(
|
|||
r-rmysql
|
||||
r-rpostgresql
|
||||
r-rsqlite
|
||||
r-stringi
|
||||
r-testthat
|
||||
r-tidyr
|
||||
r-withr
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -3,6 +3,7 @@ maintainers:
|
|||
- github: starsareintherose
|
||||
email: kuoi@bioarchlinux.org
|
||||
repo_depends:
|
||||
- r-cli
|
||||
- r-generics
|
||||
- r-glue
|
||||
- r-lifecycle
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -6,7 +6,7 @@ _pkgname=DT
|
|||
_pkgver=0.27
|
||||
pkgname=r-${_pkgname,,}
|
||||
pkgver=0.27
|
||||
pkgrel=1
|
||||
pkgrel=2
|
||||
pkgdesc="A Wrapper of the JavaScript Library 'DataTables'"
|
||||
arch=('any')
|
||||
url="https://cran.r-project.org/package=${_pkgname}"
|
||||
|
|
@ -28,6 +28,7 @@ optdepends=(
|
|||
r-rmarkdown
|
||||
r-shiny
|
||||
r-testit
|
||||
r-tibble
|
||||
)
|
||||
source=("https://cran.r-project.org/src/contrib/${_pkgname}_${_pkgver}.tar.gz")
|
||||
sha256sums=('e32fdccd2be430933cff88a9ce79045bfdbe3e08e0cd8d15037445808613289a')
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -4,7 +4,7 @@ _pkgname=effectsize
|
|||
_pkgver=0.8.3
|
||||
pkgname=r-${_pkgname,,}
|
||||
pkgver=0.8.3
|
||||
pkgrel=1
|
||||
pkgrel=2
|
||||
pkgdesc='Indices of Effect Size and Standardized Parameters'
|
||||
arch=('any')
|
||||
url="https://cran.r-project.org/package=${_pkgname}"
|
||||
|
|
@ -25,6 +25,7 @@ optdepends=(
|
|||
r-car
|
||||
r-correlation
|
||||
r-emmeans
|
||||
r-gt
|
||||
r-knitr
|
||||
r-lavaan
|
||||
r-lme4
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -4,7 +4,7 @@ _pkgname=flextable
|
|||
_pkgver=0.8.5
|
||||
pkgname=r-${_pkgname,,}
|
||||
pkgver=0.8.5
|
||||
pkgrel=1
|
||||
pkgrel=2
|
||||
pkgdesc='Functions for Tabular Reporting'
|
||||
arch=('any')
|
||||
url="https://cran.r-project.org/package=${_pkgname}"
|
||||
|
|
@ -32,15 +32,16 @@ optdepends=(
|
|||
r-equatags
|
||||
r-ggplot2
|
||||
r-lme4
|
||||
r-locatexec
|
||||
r-magick
|
||||
r-mgcv
|
||||
r-nlme
|
||||
r-officedown
|
||||
r-pdftools
|
||||
r-pkgdown
|
||||
r-ragg
|
||||
r-scales
|
||||
r-testthat
|
||||
r-webshot
|
||||
r-webshot2
|
||||
r-xtable
|
||||
)
|
||||
source=("https://cran.r-project.org/src/contrib/${_pkgname}_${_pkgver}.tar.gz")
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -5,7 +5,7 @@ _pkgname=forcats
|
|||
_pkgver=1.0.0
|
||||
pkgname=r-${_pkgname,,}
|
||||
pkgver=1.0.0
|
||||
pkgrel=1
|
||||
pkgrel=2
|
||||
pkgdesc='Tools for Working with Categorical Variables (Factors)'
|
||||
arch=('any')
|
||||
url="https://cran.r-project.org/package=${_pkgname}"
|
||||
|
|
@ -13,13 +13,11 @@ license=('MIT')
|
|||
depends=(
|
||||
r
|
||||
r-cli
|
||||
r-ellipsis
|
||||
r-glue
|
||||
r-lifecycle
|
||||
r-magrittr
|
||||
r-rlang
|
||||
r-tibble
|
||||
r-withr
|
||||
)
|
||||
optdepends=(
|
||||
r-covr
|
||||
|
|
@ -29,6 +27,7 @@ optdepends=(
|
|||
r-readr
|
||||
r-rmarkdown
|
||||
r-testthat
|
||||
r-withr
|
||||
)
|
||||
source=("https://cran.r-project.org/src/contrib/${_pkgname}_${_pkgver}.tar.gz")
|
||||
sha256sums=('c5bb157909d92e1e1a427c0dc5cb358ea00a43a14918a9088fa4f6630962254e')
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -4,13 +4,11 @@ maintainers:
|
|||
email: kuoi@bioarchlinux.org
|
||||
repo_depends:
|
||||
- r-cli
|
||||
- r-ellipsis
|
||||
- r-glue
|
||||
- r-lifecycle
|
||||
- r-magrittr
|
||||
- r-rlang
|
||||
- r-tibble
|
||||
- r-withr
|
||||
update_on:
|
||||
- regex: forcats_([\d._-]+).tar.gz
|
||||
source: regex
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -4,7 +4,7 @@ _pkgname=gap
|
|||
_pkgver=1.5-1
|
||||
pkgname=r-${_pkgname,,}
|
||||
pkgver=1.5.1
|
||||
pkgrel=1
|
||||
pkgrel=2
|
||||
pkgdesc='Genetic Analysis Package'
|
||||
arch=('x86_64')
|
||||
url="https://cran.r-project.org/package=${_pkgname}"
|
||||
|
|
@ -18,6 +18,7 @@ depends=(
|
|||
)
|
||||
optdepends=(
|
||||
r-bdsmatrix
|
||||
r-bookdown
|
||||
r-bradleyterry2
|
||||
r-calibrate
|
||||
r-circlize
|
||||
|
|
@ -44,7 +45,6 @@ optdepends=(
|
|||
r-mcmcglmm
|
||||
r-meta
|
||||
r-metafor
|
||||
r-mets
|
||||
r-nlme
|
||||
r-pedigree
|
||||
r-pedigreemm
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -5,7 +5,7 @@ _pkgname=ggiraph
|
|||
_pkgver=0.8.6
|
||||
pkgname=r-${_pkgname,,}
|
||||
pkgver=0.8.6
|
||||
pkgrel=1
|
||||
pkgrel=2
|
||||
pkgdesc="Make 'ggplot2' Graphics Interactive"
|
||||
arch=('x86_64')
|
||||
url="https://cran.r-project.org/package=${_pkgname}"
|
||||
|
|
@ -28,6 +28,7 @@ depends=(
|
|||
)
|
||||
optdepends=(
|
||||
r-dplyr
|
||||
r-gdtools
|
||||
r-ggrepel
|
||||
r-hexbin
|
||||
r-knitr
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -5,7 +5,7 @@ _pkgname=ggrepel
|
|||
_pkgver=0.9.3
|
||||
pkgname=r-${_pkgname,,}
|
||||
pkgver=0.9.3
|
||||
pkgrel=1
|
||||
pkgrel=2
|
||||
pkgdesc="Automatically Position Non-Overlapping Text Labels with 'ggplot2'"
|
||||
arch=('x86_64')
|
||||
url="https://cran.r-project.org/package=${_pkgname}"
|
||||
|
|
@ -16,6 +16,7 @@ depends=(
|
|||
r-rcpp
|
||||
r-rlang
|
||||
r-scales
|
||||
r-withr
|
||||
)
|
||||
optdepends=(
|
||||
r-devtools
|
||||
|
|
@ -31,7 +32,6 @@ optdepends=(
|
|||
r-svglite
|
||||
r-testthat
|
||||
r-vdiffr
|
||||
r-withr
|
||||
)
|
||||
source=("https://cran.r-project.org/src/contrib/${_pkgname}_${_pkgver}.tar.gz")
|
||||
sha256sums=('b9eba0e2edee84db0276b49e4834b65f5369edc4bc56f4cacc13e0d1c39a005c')
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -7,6 +7,7 @@ repo_depends:
|
|||
- r-rcpp
|
||||
- r-rlang
|
||||
- r-scales
|
||||
- r-withr
|
||||
update_on:
|
||||
- regex: ggrepel_([\d._-]+).tar.gz
|
||||
source: regex
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -4,7 +4,7 @@ _pkgname=Hmisc
|
|||
_pkgver=4.8-0
|
||||
pkgname=r-${_pkgname,,}
|
||||
pkgver=4.8.0
|
||||
pkgrel=1
|
||||
pkgrel=2
|
||||
pkgdesc='Harrell Miscellaneous'
|
||||
arch=('x86_64')
|
||||
url="https://cran.r-project.org/package=${_pkgname}"
|
||||
|
|
@ -12,6 +12,7 @@ license=('GPL')
|
|||
depends=(
|
||||
r
|
||||
r-base64enc
|
||||
r-colorspace
|
||||
r-data.table
|
||||
r-formula
|
||||
r-ggplot2
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -4,6 +4,7 @@ maintainers:
|
|||
email: kuoi@bioarchlinux.org
|
||||
repo_depends:
|
||||
- r-base64enc
|
||||
- r-colorspace
|
||||
- r-data.table
|
||||
- r-formula
|
||||
- r-ggplot2
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -4,7 +4,7 @@ _pkgname=insight
|
|||
_pkgver=0.19.0
|
||||
pkgname=r-${_pkgname,,}
|
||||
pkgver=0.19.0
|
||||
pkgrel=1
|
||||
pkgrel=2
|
||||
pkgdesc='Easy Access to Model Information for Various Model Objects'
|
||||
arch=('any')
|
||||
url="https://cran.r-project.org/package=${_pkgname}"
|
||||
|
|
@ -47,6 +47,7 @@ optdepends=(
|
|||
r-gbm
|
||||
r-gee
|
||||
r-geepack
|
||||
r-geor
|
||||
r-glmmadaptive
|
||||
r-glmmtmb
|
||||
r-gmnl
|
||||
|
|
@ -75,6 +76,7 @@ optdepends=(
|
|||
r-mhurdle
|
||||
r-mice
|
||||
r-mlogit
|
||||
r-mmrm
|
||||
r-multgee
|
||||
r-nlme
|
||||
r-nnet
|
||||
|
|
@ -104,6 +106,7 @@ optdepends=(
|
|||
r-survey
|
||||
r-survival
|
||||
r-testthat
|
||||
r-tmb
|
||||
r-truncreg
|
||||
r-tweedie
|
||||
r-vgam
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -4,7 +4,7 @@ _pkgname=ISAnalytics
|
|||
_pkgver=1.8.1
|
||||
pkgname=r-${_pkgname,,}
|
||||
pkgver=1.8.1
|
||||
pkgrel=1
|
||||
pkgrel=2
|
||||
pkgdesc='Analyze gene therapy vector insertion sites data identified from genomics next generation sequencing reads for clonal tracking studies'
|
||||
arch=('any')
|
||||
url="https://bioconductor.org/packages/${_pkgname}"
|
||||
|
|
@ -15,7 +15,6 @@ depends=(
|
|||
r-data.table
|
||||
r-datamods
|
||||
r-dplyr
|
||||
r-dt # manually added
|
||||
r-forcats
|
||||
r-fs
|
||||
r-ggplot2
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -7,7 +7,6 @@ repo_depends:
|
|||
- r-data.table
|
||||
- r-datamods
|
||||
- r-dplyr
|
||||
- r-dt
|
||||
- r-forcats
|
||||
- r-fs
|
||||
- r-ggplot2
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -5,20 +5,19 @@ _pkgname=knitr
|
|||
_pkgver=1.42
|
||||
pkgname=r-${_pkgname,,}
|
||||
pkgver=1.42
|
||||
pkgrel=1
|
||||
pkgrel=2
|
||||
pkgdesc='A General-Purpose Package for Dynamic Report Generation in R'
|
||||
arch=('any')
|
||||
url="https://cran.r-project.org/package=${_pkgname}"
|
||||
license=('GPL')
|
||||
depends=(
|
||||
pandoc
|
||||
r
|
||||
rst2pdf
|
||||
r-evaluate
|
||||
r-highr
|
||||
r-stringr
|
||||
r-xfun
|
||||
r-yaml
|
||||
rst2pdf
|
||||
pandoc
|
||||
)
|
||||
optdepends=(
|
||||
r-bslib
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -5,7 +5,6 @@ maintainers:
|
|||
repo_depends:
|
||||
- r-evaluate
|
||||
- r-highr
|
||||
- r-stringr
|
||||
- r-xfun
|
||||
- r-yaml
|
||||
update_on:
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -4,7 +4,7 @@ _pkgname=markdown
|
|||
_pkgver=1.5
|
||||
pkgname=r-${_pkgname,,}
|
||||
pkgver=1.5
|
||||
pkgrel=1
|
||||
pkgrel=2
|
||||
pkgdesc="Render Markdown with the C Library 'Sundown'"
|
||||
arch=('any')
|
||||
url="https://cran.r-project.org/package=${_pkgname}"
|
||||
|
|
@ -12,7 +12,6 @@ license=('GPL')
|
|||
depends=(
|
||||
r
|
||||
r-commonmark
|
||||
r-mime
|
||||
r-xfun
|
||||
)
|
||||
optdepends=(
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -4,7 +4,6 @@ maintainers:
|
|||
email: kuoi@bioarchlinux.org
|
||||
repo_depends:
|
||||
- r-commonmark
|
||||
- r-mime
|
||||
- r-xfun
|
||||
update_on:
|
||||
- regex: markdown_([\d._-]+).tar.gz
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -4,7 +4,7 @@ _pkgname=martini
|
|||
_pkgver=1.18.1
|
||||
pkgname=r-${_pkgname,,}
|
||||
pkgver=1.18.1
|
||||
pkgrel=1
|
||||
pkgrel=2
|
||||
pkgdesc='GWAS Incorporating Networks'
|
||||
arch=('x86_64')
|
||||
url="https://bioconductor.org/packages/${_pkgname}"
|
||||
|
|
@ -23,7 +23,6 @@ optdepends=(
|
|||
r-httr
|
||||
r-iranges
|
||||
r-knitr
|
||||
r-memoise
|
||||
r-readr
|
||||
r-rmarkdown
|
||||
r-s4vectors
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -4,7 +4,7 @@ _pkgname=officer
|
|||
_pkgver=0.5.2
|
||||
pkgname=r-${_pkgname,,}
|
||||
pkgver=0.5.2
|
||||
pkgrel=1
|
||||
pkgrel=2
|
||||
pkgdesc='Manipulation of Microsoft Word and PowerPoint Documents'
|
||||
arch=('any')
|
||||
url="https://cran.r-project.org/package=${_pkgname}"
|
||||
|
|
@ -23,6 +23,7 @@ optdepends=(
|
|||
r-doconv
|
||||
r-ggplot2
|
||||
r-knitr
|
||||
r-magick
|
||||
r-rmarkdown
|
||||
r-rsvg
|
||||
r-testthat
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -4,7 +4,7 @@ _pkgname=parameters
|
|||
_pkgver=0.20.2
|
||||
pkgname=r-${_pkgname,,}
|
||||
pkgver=0.20.2
|
||||
pkgrel=1
|
||||
pkgrel=2
|
||||
pkgdesc='Processing of Model Parameters'
|
||||
arch=('any')
|
||||
url="https://cran.r-project.org/package=${_pkgname}"
|
||||
|
|
@ -73,7 +73,6 @@ optdepends=(
|
|||
r-logspline
|
||||
r-lqmm
|
||||
r-m3c
|
||||
r-magrittr
|
||||
r-marginaleffects
|
||||
r-mass
|
||||
r-matrix
|
||||
|
|
@ -86,6 +85,7 @@ optdepends=(
|
|||
r-mfx
|
||||
r-mgcv
|
||||
r-mice
|
||||
r-mmrm
|
||||
r-multcomp
|
||||
r-mumin
|
||||
r-nbclust
|
||||
|
|
@ -111,7 +111,6 @@ optdepends=(
|
|||
r-rmarkdown
|
||||
r-rms
|
||||
r-rstanarm
|
||||
r-rsvd
|
||||
r-sandwich
|
||||
r-see
|
||||
r-sparsepca
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -4,7 +4,7 @@ _pkgname=pbapply
|
|||
_pkgver=1.7-0
|
||||
pkgname=r-${_pkgname,,}
|
||||
pkgver=1.7.0
|
||||
pkgrel=1
|
||||
pkgrel=2
|
||||
pkgdesc="Adding Progress Bar to '*apply' Functions"
|
||||
arch=('any')
|
||||
url="https://cran.r-project.org/package=${_pkgname}"
|
||||
|
|
@ -13,6 +13,8 @@ depends=(
|
|||
r
|
||||
)
|
||||
optdepends=(
|
||||
r-future
|
||||
r-future.apply
|
||||
r-shiny
|
||||
)
|
||||
source=("https://cran.r-project.org/src/contrib/${_pkgname}_${_pkgver}.tar.gz")
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -6,7 +6,7 @@ _pkgname=pbkrtest
|
|||
_pkgver=0.5.2
|
||||
pkgname=r-${_pkgname,,}
|
||||
pkgver=0.5.2
|
||||
pkgrel=1
|
||||
pkgrel=2
|
||||
pkgdesc='Parametric Bootstrap, Kenward-Roger and Satterthwaite Based Methods for Test in Mixed Models'
|
||||
arch=('any')
|
||||
url="https://cran.r-project.org/package=${_pkgname}"
|
||||
|
|
@ -15,11 +15,12 @@ depends=(
|
|||
r
|
||||
r-broom
|
||||
r-dplyr
|
||||
r-knitr
|
||||
r-lme4
|
||||
r-magrittr
|
||||
r-numderiv
|
||||
)
|
||||
optdepends=(
|
||||
r-knitr
|
||||
)
|
||||
source=("https://cran.r-project.org/src/contrib/${_pkgname}_${_pkgver}.tar.gz")
|
||||
sha256sums=('8e79adf035a0fcf3c82145ad55847497379e009f7be880ba3007ebeb2e69b6e3')
|
||||
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -5,9 +5,7 @@ maintainers:
|
|||
repo_depends:
|
||||
- r-broom
|
||||
- r-dplyr
|
||||
- r-knitr
|
||||
- r-lme4
|
||||
- r-magrittr
|
||||
- r-numderiv
|
||||
update_on:
|
||||
- regex: pbkrtest_([\d._-]+).tar.gz
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -4,7 +4,7 @@ _pkgname=performance
|
|||
_pkgver=0.10.2
|
||||
pkgname=r-${_pkgname,,}
|
||||
pkgver=0.10.2
|
||||
pkgrel=1
|
||||
pkgrel=2
|
||||
pkgdesc='Assessment of Regression Models Performance'
|
||||
arch=('any')
|
||||
url="https://cran.r-project.org/package=${_pkgname}"
|
||||
|
|
@ -37,6 +37,7 @@ optdepends=(
|
|||
r-ggplot2
|
||||
r-glmmtmb
|
||||
r-graphics
|
||||
r-hmisc
|
||||
r-httr
|
||||
r-ics
|
||||
r-icsoutlier
|
||||
|
|
@ -45,7 +46,6 @@ optdepends=(
|
|||
r-lme4
|
||||
r-lmtest
|
||||
r-loo
|
||||
r-magrittr
|
||||
r-mass
|
||||
r-matrix
|
||||
r-mclust
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -4,7 +4,7 @@ _pkgname=phangorn
|
|||
_pkgver=2.11.1
|
||||
pkgname=r-${_pkgname,,}
|
||||
pkgver=2.11.1
|
||||
pkgrel=1
|
||||
pkgrel=2
|
||||
pkgdesc='Phylogenetic Reconstruction and Analysis'
|
||||
arch=('x86_64')
|
||||
url="https://cran.r-project.org/package=${_pkgname}"
|
||||
|
|
@ -23,7 +23,6 @@ optdepends=(
|
|||
r-biostrings
|
||||
r-knitr
|
||||
r-magick
|
||||
r-prettydoc
|
||||
r-rgl
|
||||
r-rmarkdown
|
||||
r-seqinr
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -4,7 +4,7 @@ _pkgname=pkgmaker
|
|||
_pkgver=0.32.2
|
||||
pkgname=r-${_pkgname,,}
|
||||
pkgver=0.32.2
|
||||
pkgrel=7
|
||||
pkgrel=8
|
||||
pkgdesc='Development Utilities for R Packages'
|
||||
arch=('any')
|
||||
url="https://cran.r-project.org/package=${_pkgname}"
|
||||
|
|
@ -31,7 +31,7 @@ optdepends=(
|
|||
r-testthat
|
||||
r-yaml
|
||||
)
|
||||
source=("https://cran.r-project.org/src/contrib/Archive/${_pkgname}/${_pkgname}_${_pkgver}.tar.gz")
|
||||
source=("https://cran.r-project.org/src/contrib/${_pkgname}_${_pkgver}.tar.gz")
|
||||
sha256sums=('ce45b22def771a9c90a414093823e6befe7e23489c500eeccee5154b44d3ef91')
|
||||
|
||||
build() {
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -12,5 +12,5 @@ repo_depends:
|
|||
update_on:
|
||||
- regex: pkgmaker_([\d._-]+).tar.gz
|
||||
source: regex
|
||||
url: https://cran.r-project.org/src/contrib/Archive/pkgmaker
|
||||
url: https://cran.r-project.org/package=pkgmaker
|
||||
- alias: r
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -4,7 +4,7 @@ _pkgname=precrec
|
|||
_pkgver=0.14.1
|
||||
pkgname=r-${_pkgname,,}
|
||||
pkgver=0.14.1
|
||||
pkgrel=1
|
||||
pkgrel=2
|
||||
pkgdesc='Calculate Accurate Precision-Recall and ROC (Receiver Operator Characteristics) Curves'
|
||||
arch=('x86_64')
|
||||
url="https://cran.r-project.org/package=${_pkgname}"
|
||||
|
|
@ -16,12 +16,15 @@ depends=(
|
|||
r-ggplot2
|
||||
r-gridextra
|
||||
r-rcpp
|
||||
r-rlang
|
||||
r-withr
|
||||
)
|
||||
optdepends=(
|
||||
r-knitr
|
||||
r-patchwork
|
||||
r-rmarkdown
|
||||
r-testthat
|
||||
r-vdiffr
|
||||
)
|
||||
source=("https://cran.r-project.org/src/contrib/${_pkgname}_${_pkgver}.tar.gz")
|
||||
sha256sums=('a81be3001ad25ff8d2dfff29390a08008875e0b4e4a8e398e37f8d4b18c7fe12')
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -8,6 +8,7 @@ repo_depends:
|
|||
- r-ggplot2
|
||||
- r-gridextra
|
||||
- r-rcpp
|
||||
- r-rlang
|
||||
- r-withr
|
||||
update_on:
|
||||
- regex: precrec_([\d._-]+).tar.gz
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -4,7 +4,7 @@ _pkgname=progressr
|
|||
_pkgver=0.13.0
|
||||
pkgname=r-${_pkgname,,}
|
||||
pkgver=0.13.0
|
||||
pkgrel=1
|
||||
pkgrel=2
|
||||
pkgdesc='An Inclusive, Unifying API for Progress Updates'
|
||||
arch=('any')
|
||||
url="https://cran.r-project.org/package=${_pkgname}"
|
||||
|
|
@ -29,6 +29,7 @@ optdepends=(
|
|||
r-plyr
|
||||
r-progress
|
||||
r-purrr
|
||||
r-rpushbullet
|
||||
r-rstudioapi
|
||||
r-shiny
|
||||
r-tcltk
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -4,7 +4,7 @@ _pkgname=Prostar
|
|||
_pkgver=1.30.3
|
||||
pkgname=r-${_pkgname,,}
|
||||
pkgver=1.30.3
|
||||
pkgrel=1
|
||||
pkgrel=2
|
||||
pkgdesc='Provides a GUI for DAPAR'
|
||||
arch=('any')
|
||||
url="https://bioconductor.org/packages/${_pkgname}"
|
||||
|
|
@ -41,6 +41,7 @@ optdepends=(
|
|||
r-gtools
|
||||
r-knitr
|
||||
r-r.utils
|
||||
r-rclipboard
|
||||
r-rcolorbrewer
|
||||
r-sass
|
||||
r-shinytree
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -5,22 +5,23 @@ _pkgname=questionr
|
|||
_pkgver=0.7.8
|
||||
pkgname=r-${_pkgname,,}
|
||||
pkgver=0.7.8
|
||||
pkgrel=1
|
||||
pkgrel=2
|
||||
pkgdesc='Functions to Make Surveys Processing Easier'
|
||||
arch=('any')
|
||||
url="https://cran.r-project.org/package=${_pkgname}"
|
||||
license=('GPL')
|
||||
depends=(
|
||||
r
|
||||
xclip
|
||||
r-classint
|
||||
r-highr
|
||||
r-htmltools
|
||||
r-labelled
|
||||
r-miniui
|
||||
r-rlang
|
||||
r-rstudioapi
|
||||
r-shiny
|
||||
r-styler
|
||||
xclip
|
||||
)
|
||||
optdepends=(
|
||||
r-dplyr
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -8,6 +8,7 @@ repo_depends:
|
|||
- r-htmltools
|
||||
- r-labelled
|
||||
- r-miniui
|
||||
- r-rlang
|
||||
- r-rstudioapi
|
||||
- r-shiny
|
||||
- r-styler
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -5,7 +5,7 @@ _pkgname=RcppAlgos
|
|||
_pkgver=2.7.1
|
||||
pkgname=r-${_pkgname,,}
|
||||
pkgver=2.7.1
|
||||
pkgrel=1
|
||||
pkgrel=2
|
||||
pkgdesc='High Performance Tools for Combinatorics and Computational Mathematics'
|
||||
arch=('x86_64')
|
||||
url="https://cran.r-project.org/package=${_pkgname}"
|
||||
|
|
@ -18,7 +18,6 @@ depends=(
|
|||
optdepends=(
|
||||
r-knitr
|
||||
r-microbenchmark
|
||||
r-numbers
|
||||
r-partitions
|
||||
r-rcppbigintalgos
|
||||
r-rmarkdown
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -4,7 +4,7 @@ _pkgname=readxl
|
|||
_pkgver=1.4.2
|
||||
pkgname=r-${_pkgname,,}
|
||||
pkgver=1.4.2
|
||||
pkgrel=1
|
||||
pkgrel=2
|
||||
pkgdesc='Read Excel Files'
|
||||
arch=('x86_64')
|
||||
url="https://cran.r-project.org/package=${_pkgname}"
|
||||
|
|
@ -17,9 +17,11 @@ depends=(
|
|||
r-tibble
|
||||
)
|
||||
optdepends=(
|
||||
r-covr
|
||||
r-knitr
|
||||
r-rmarkdown
|
||||
r-testthat
|
||||
r-withr
|
||||
)
|
||||
source=("https://cran.r-project.org/src/contrib/${_pkgname}_${_pkgver}.tar.gz")
|
||||
sha256sums=('387304e2c5be0dca4861ec0232f0d92cc1882b660ca917f8f2a8a4ae858aba11')
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -4,7 +4,7 @@ _pkgname=report
|
|||
_pkgver=0.5.5
|
||||
pkgname=r-${_pkgname,,}
|
||||
pkgver=0.5.5
|
||||
pkgrel=3
|
||||
pkgrel=4
|
||||
pkgdesc='Automated Reporting of Results and Statistical Models'
|
||||
arch=('any')
|
||||
url="https://github.com/easystats/report"
|
||||
|
|
@ -19,7 +19,6 @@ depends=(
|
|||
r-performance
|
||||
)
|
||||
optdepends=(
|
||||
r-bayesfactor
|
||||
r-brms
|
||||
r-dplyr
|
||||
r-ivreg
|
||||
|
|
@ -31,7 +30,7 @@ optdepends=(
|
|||
r-survival
|
||||
r-testthat
|
||||
)
|
||||
source=("${_pkgname}_${pkgver}.tar.gz::https://github.com/easystats/report/archive/refs/tags/${pkgver}.tar.gz")
|
||||
source=("${_pkgname}_${pkgver}.tar.gz::${url}/archive/refs/tags/${pkgver}.tar.gz")
|
||||
sha256sums=('4a6ae6cb6690a37b654d52d7ea5b25872655bb9a8d250ea934437a7fde74e829')
|
||||
|
||||
build() {
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -12,3 +12,4 @@ update_on:
|
|||
- source: github
|
||||
github: easystats/report
|
||||
use_max_tag: true
|
||||
prefix: v
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -5,7 +5,7 @@ _pkgname=rmarkdown
|
|||
_pkgver=2.20
|
||||
pkgname=r-${_pkgname,,}
|
||||
pkgver=2.20
|
||||
pkgrel=1
|
||||
pkgrel=2
|
||||
pkgdesc='Dynamic Documents for R'
|
||||
arch=('any')
|
||||
url="https://cran.r-project.org/package=${_pkgname}"
|
||||
|
|
@ -34,7 +34,6 @@ optdepends=(
|
|||
r-shiny
|
||||
r-testthat
|
||||
r-tibble
|
||||
r-tufte
|
||||
r-vctrs
|
||||
r-withr
|
||||
)
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -5,7 +5,7 @@ _pkgname=Rmpfr
|
|||
_pkgver=0.9-1
|
||||
pkgname=r-${_pkgname,,}
|
||||
pkgver=0.9.1
|
||||
pkgrel=1
|
||||
pkgrel=2
|
||||
pkgdesc='R MPFR - Multiple Precision Floating-Point Reliable'
|
||||
arch=('x86_64')
|
||||
url="https://cran.r-project.org/package=${_pkgname}"
|
||||
|
|
@ -17,8 +17,8 @@ depends=(
|
|||
optdepends=(
|
||||
r-bessel
|
||||
r-dfoptim
|
||||
r-dpq
|
||||
r-mass
|
||||
r-matrix
|
||||
r-polynom
|
||||
r-pracma
|
||||
r-sfsmisc
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -4,7 +4,7 @@ _pkgname=scRecover
|
|||
_pkgver=1.14.1
|
||||
pkgname=r-${_pkgname,,}
|
||||
pkgver=1.14.1
|
||||
pkgrel=1
|
||||
pkgrel=2
|
||||
pkgdesc='scRecover for imputation of single-cell RNA-seq data'
|
||||
arch=('any')
|
||||
url="https://bioconductor.org/packages/${_pkgname}"
|
||||
|
|
@ -20,7 +20,6 @@ depends=(
|
|||
r-penalized
|
||||
r-preseqr
|
||||
r-pscl
|
||||
r-rmagic
|
||||
r-rsvd
|
||||
r-saver
|
||||
)
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -12,7 +12,6 @@ repo_depends:
|
|||
- r-penalized
|
||||
- r-preseqr
|
||||
- r-pscl
|
||||
- r-rmagic
|
||||
- r-rsvd
|
||||
- r-saver
|
||||
update_on:
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -4,7 +4,7 @@ _pkgname=sendmailR
|
|||
_pkgver=1.4-0
|
||||
pkgname=r-${_pkgname,,}
|
||||
pkgver=1.4.0
|
||||
pkgrel=1
|
||||
pkgrel=2
|
||||
pkgdesc='send email using R'
|
||||
arch=('any')
|
||||
url="https://cran.r-project.org/package=${_pkgname}"
|
||||
|
|
@ -13,6 +13,12 @@ depends=(
|
|||
r
|
||||
r-base64enc
|
||||
)
|
||||
optdepends=(
|
||||
r-curl
|
||||
r-htmltools
|
||||
r-knitr
|
||||
r-rmarkdown
|
||||
)
|
||||
source=("https://cran.r-project.org/src/contrib/${_pkgname}_${_pkgver}.tar.gz")
|
||||
sha256sums=('5b8b91fc13f6b07b9fc5a2cf7591cf760fad47c5ea17d87a2891898c506454ad')
|
||||
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -4,7 +4,7 @@ _pkgname=statnet.common
|
|||
_pkgver=4.8.0
|
||||
pkgname=r-${_pkgname,,}
|
||||
pkgver=4.8.0
|
||||
pkgrel=1
|
||||
pkgrel=2
|
||||
pkgdesc='Common R Scripts and Utilities Used by the Statnet Project Software'
|
||||
arch=('x86_64')
|
||||
url="https://cran.r-project.org/package=${_pkgname}"
|
||||
|
|
@ -15,6 +15,7 @@ depends=(
|
|||
)
|
||||
optdepends=(
|
||||
r-covr
|
||||
r-rlang
|
||||
)
|
||||
source=("https://cran.r-project.org/src/contrib/${_pkgname}_${_pkgver}.tar.gz")
|
||||
sha256sums=('def999130673fbcb315fecf3620a2559864f51961a828625aa5cd5fded7946f0')
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -5,7 +5,7 @@ _pkgname=texreg
|
|||
_pkgver=1.38.6
|
||||
pkgname=r-${_pkgname,,}
|
||||
pkgver=1.38.6
|
||||
pkgrel=1
|
||||
pkgrel=2
|
||||
pkgdesc='Conversion of R Regression Output to LaTeX or HTML Tables'
|
||||
arch=('any')
|
||||
url="https://cran.r-project.org/package=${_pkgname}"
|
||||
|
|
@ -15,7 +15,7 @@ depends=(
|
|||
r-httr
|
||||
)
|
||||
optdepends=(
|
||||
'pandoc: suggested for using wordregfunction'
|
||||
pandoc: suggested for using wordregfunction
|
||||
r-aer
|
||||
r-alpaca
|
||||
r-bergm
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -1,13 +1,15 @@
|
|||
build_prefix: extra-x86_64
|
||||
maintainers:
|
||||
- github: sukanka
|
||||
post_build_script: |
|
||||
git_pkgbuild_commit()
|
||||
- github: sukanka
|
||||
post_build_script: 'git_pkgbuild_commit()
|
||||
|
||||
update_aur_repo()
|
||||
|
||||
'
|
||||
repo_depends:
|
||||
- r-httr
|
||||
- r-httr
|
||||
update_on:
|
||||
- regex: texreg_([\d._-]+).tar.gz
|
||||
source: regex
|
||||
url: https://cran.r-project.org/package=texreg
|
||||
- alias: r
|
||||
- regex: texreg_([\d._-]+).tar.gz
|
||||
source: regex
|
||||
url: https://cran.r-project.org/package=texreg
|
||||
- alias: r
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -4,7 +4,7 @@ _pkgname=tidybayes
|
|||
_pkgver=3.0.3
|
||||
pkgname=r-${_pkgname,,}
|
||||
pkgver=3.0.3
|
||||
pkgrel=1
|
||||
pkgrel=2
|
||||
pkgdesc="Tidy Data and 'Geoms' for Bayesian Models"
|
||||
arch=('any')
|
||||
url="https://cran.r-project.org/package=${_pkgname}"
|
||||
|
|
@ -36,7 +36,6 @@ optdepends=(
|
|||
r-dotwhisker
|
||||
r-emmeans
|
||||
r-forcats
|
||||
r-gdtools
|
||||
r-gganimate
|
||||
r-ggrepel
|
||||
r-gifski
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -5,7 +5,7 @@ _pkgname=tiledb
|
|||
_pkgver=0.18.0
|
||||
pkgname=r-${_pkgname,,}
|
||||
pkgver=0.18.0
|
||||
pkgrel=1
|
||||
pkgrel=2
|
||||
pkgdesc='Universal Storage Engine for Sparse and Dense Multidimensional Arrays'
|
||||
arch=('x86_64')
|
||||
url="https://cran.r-project.org/package=${_pkgname}"
|
||||
|
|
@ -14,7 +14,6 @@ depends=(
|
|||
r
|
||||
r-nanotime
|
||||
r-rcpp
|
||||
r-rcppspdlog
|
||||
r-spdl
|
||||
)
|
||||
optdepends=(
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -5,7 +5,6 @@ maintainers:
|
|||
repo_depends:
|
||||
- r-nanotime
|
||||
- r-rcpp
|
||||
- r-rcppspdlog
|
||||
- r-spdl
|
||||
update_on:
|
||||
- regex: tiledb_([\d._-]+).tar.gz
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -5,7 +5,7 @@ _pkgname=torch
|
|||
_pkgver=0.9.1
|
||||
pkgname=r-${_pkgname,,}
|
||||
pkgver=0.9.1
|
||||
pkgrel=1
|
||||
pkgrel=2
|
||||
pkgdesc="Tensors and Neural Networks with 'GPU' Acceleration"
|
||||
arch=('x86_64')
|
||||
url="https://cran.r-project.org/package=${_pkgname}"
|
||||
|
|
@ -17,6 +17,7 @@ depends=(
|
|||
r-cli
|
||||
r-coro
|
||||
r-ellipsis
|
||||
r-glue
|
||||
r-magrittr
|
||||
r-r6
|
||||
r-rcpp
|
||||
|
|
@ -25,7 +26,6 @@ depends=(
|
|||
)
|
||||
optdepends=(
|
||||
r-covr
|
||||
r-glue
|
||||
r-katex
|
||||
r-knitr
|
||||
r-mvtnorm
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -1,21 +1,24 @@
|
|||
build_prefix: extra-x86_64
|
||||
maintainers:
|
||||
- github: sukanka
|
||||
post_build_script: |
|
||||
git_pkgbuild_commit()
|
||||
- github: sukanka
|
||||
post_build_script: 'git_pkgbuild_commit()
|
||||
|
||||
update_aur_repo()
|
||||
|
||||
'
|
||||
repo_depends:
|
||||
- r-bit64
|
||||
- r-callr
|
||||
- r-cli
|
||||
- r-coro
|
||||
- r-ellipsis
|
||||
- r-magrittr
|
||||
- r-r6
|
||||
- r-rcpp
|
||||
- r-rlang
|
||||
- r-withr
|
||||
- r-bit64
|
||||
- r-callr
|
||||
- r-cli
|
||||
- r-coro
|
||||
- r-ellipsis
|
||||
- r-glue
|
||||
- r-magrittr
|
||||
- r-r6
|
||||
- r-rcpp
|
||||
- r-rlang
|
||||
- r-withr
|
||||
update_on:
|
||||
- regex: torch_([\d._-]+).tar.gz
|
||||
source: regex
|
||||
url: https://cran.r-project.org/package=torch
|
||||
- regex: torch_([\d._-]+).tar.gz
|
||||
source: regex
|
||||
url: https://cran.r-project.org/package=torch
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -4,7 +4,7 @@ _pkgname=vcdExtra
|
|||
_pkgver=0.8-2
|
||||
pkgname=r-${_pkgname,,}
|
||||
pkgver=0.8.2
|
||||
pkgrel=1
|
||||
pkgrel=2
|
||||
pkgdesc="'vcd' Extensions and Additions"
|
||||
arch=('any')
|
||||
url="https://cran.r-project.org/package=${_pkgname}"
|
||||
|
|
@ -31,6 +31,7 @@ optdepends=(
|
|||
r-plyr
|
||||
r-rgl
|
||||
r-rmarkdown
|
||||
r-seriation
|
||||
r-sleuth2
|
||||
r-stats4
|
||||
r-vgam
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -1,12 +1,12 @@
|
|||
build_prefix: extra-x86_64
|
||||
maintainers:
|
||||
- github: sukanka
|
||||
- github: sukanka
|
||||
repo_depends:
|
||||
- r-ca
|
||||
- r-gnm
|
||||
- r-vcd
|
||||
- r-ca
|
||||
- r-gnm
|
||||
- r-vcd
|
||||
update_on:
|
||||
- regex: vcdExtra_([\d._-]+).tar.gz
|
||||
source: regex
|
||||
url: https://cran.r-project.org/package=vcdExtra
|
||||
- alias: r
|
||||
- regex: vcdExtra_([\d._-]+).tar.gz
|
||||
source: regex
|
||||
url: https://cran.r-project.org/package=vcdExtra
|
||||
- alias: r
|
||||
|
|
|
|||
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