mirror of
https://github.com/BioArchLinux/Packages.git
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a63f869663
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16e0e86ef4
12 changed files with 364 additions and 0 deletions
57
BioArchLinux/r-correlation/PKGBUILD
Normal file
57
BioArchLinux/r-correlation/PKGBUILD
Normal file
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@ -0,0 +1,57 @@
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||||||
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# Maintainer: Pekka Ristola <pekkarr [at] protonmail [dot] com>
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_pkgname=correlation
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||||||
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||||||
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||||||
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)
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optdepends=(
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r-rmarkdown
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||||||
|
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|
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|
r-testthat
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||||||
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||||||
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||||||
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r-wrs2
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||||||
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)
|
||||||
|
source=("https://cran.r-project.org/src/contrib/${_pkgname}_${_pkgver}.tar.gz")
|
||||||
|
md5sums=('fdd4bce864c73bd9d5f8a7725a8a906b')
|
||||||
|
b2sums=('f171ea2abe4842efeef30a0fb6af544053b1853f5d0d3553079f98bdc3470bafd63090a122d1f204e03c794b0276b32529737b83b4c65268b3875b758e1fdb84')
|
||||||
|
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|
build() {
|
||||||
|
mkdir build
|
||||||
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R CMD INSTALL -l build "$_pkgname"
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||||||
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}
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||||||
|
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||||||
|
package() {
|
||||||
|
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|
||||||
|
cp -a --no-preserve=ownership "build/$_pkgname" "$pkgdir/usr/lib/R/library"
|
||||||
|
|
||||||
|
install -d "$pkgdir/usr/share/licenses/$pkgname"
|
||||||
|
ln -s "/usr/lib/R/library/$_pkgname/LICENSE" "$pkgdir/usr/share/licenses/$pkgname"
|
||||||
|
}
|
14
BioArchLinux/r-correlation/lilac.py
Normal file
14
BioArchLinux/r-correlation/lilac.py
Normal file
|
@ -0,0 +1,14 @@
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||||||
|
#!/usr/bin/env python3
|
||||||
|
from lilaclib import *
|
||||||
|
|
||||||
|
import os
|
||||||
|
import sys
|
||||||
|
sys.path.append(os.path.normpath(f'{__file__}/../../../lilac-extensions'))
|
||||||
|
from lilac_r_utils import r_pre_build
|
||||||
|
|
||||||
|
def pre_build():
|
||||||
|
r_pre_build(_G)
|
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|
|
||||||
|
def post_build():
|
||||||
|
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|
||||||
|
update_aur_repo()
|
15
BioArchLinux/r-correlation/lilac.yaml
Normal file
15
BioArchLinux/r-correlation/lilac.yaml
Normal file
|
@ -0,0 +1,15 @@
|
||||||
|
build_prefix: extra-x86_64
|
||||||
|
maintainers:
|
||||||
|
- github: pekkarr
|
||||||
|
email: pekkarr@protonmail.com
|
||||||
|
repo_depends:
|
||||||
|
- r-bayestestr
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||||||
|
- r-datawizard
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||||||
|
- r-insight
|
||||||
|
- r-parameters
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||||||
|
update_on:
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||||||
|
- source: rpkgs
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||||||
|
pkgname: correlation
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||||||
|
repo: cran
|
||||||
|
md5: true
|
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|
- alias: r
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62
BioArchLinux/r-ggstatsplot/PKGBUILD
Normal file
62
BioArchLinux/r-ggstatsplot/PKGBUILD
Normal file
|
@ -0,0 +1,62 @@
|
||||||
|
# Maintainer: Pekka Ristola <pekkarr [at] protonmail [dot] com>
|
||||||
|
|
||||||
|
_pkgname=ggstatsplot
|
||||||
|
_pkgver=0.13.0
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||||||
|
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|
||||||
|
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|
||||||
|
pkgrel=1
|
||||||
|
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|
||||||
|
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|
||||||
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url="https://cran.r-project.org/package=$_pkgname"
|
||||||
|
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|
||||||
|
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|
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|
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|
r-datawizard
|
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||||||
|
r-ggcorrplot
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||||||
|
r-ggplot2
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|
r-ggrepel
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||||||
|
r-ggside
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|
r-ggsignif
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|
r-glue
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r-insight
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|
r-paletteer
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||||||
|
r-parameters
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||||||
|
r-patchwork
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||||||
|
r-performance
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|
r-purrr
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|
r-rlang
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||||||
|
r-statsexpressions
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||||||
|
r-tidyr
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||||||
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)
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||||||
|
optdepends=(
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||||||
|
r-afex
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||||||
|
r-bayesfactor
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||||||
|
r-gapminder
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||||||
|
r-knitr
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||||||
|
r-lme4
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||||||
|
r-metabma
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||||||
|
r-metafor
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||||||
|
r-metaplus
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||||||
|
r-psych
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||||||
|
r-rmarkdown
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||||||
|
r-rstantools
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||||||
|
r-testthat
|
||||||
|
r-tibble
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||||||
|
r-vdiffr
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||||||
|
r-withr
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|
r-wrs2
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||||||
|
)
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||||||
|
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|
||||||
|
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|
||||||
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b2sums=('2beafe410bca06a266ea835c0aa9e4545161d1b8476268061fff4676659d679993c16b28afd47801ebb13c70cdf72b8f8bc21ba36b498d33a15e70f71e3d4fc0')
|
||||||
|
|
||||||
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build() {
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|
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|
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|
}
|
||||||
|
|
||||||
|
package() {
|
||||||
|
install -d "$pkgdir/usr/lib/R/library"
|
||||||
|
cp -a --no-preserve=ownership "build/$_pkgname" "$pkgdir/usr/lib/R/library"
|
||||||
|
}
|
17
BioArchLinux/r-ggstatsplot/lilac.py
Normal file
17
BioArchLinux/r-ggstatsplot/lilac.py
Normal file
|
@ -0,0 +1,17 @@
|
||||||
|
#!/usr/bin/env python3
|
||||||
|
from lilaclib import *
|
||||||
|
|
||||||
|
import os
|
||||||
|
import sys
|
||||||
|
sys.path.append(os.path.normpath(f'{__file__}/../../../lilac-extensions'))
|
||||||
|
from lilac_r_utils import r_pre_build
|
||||||
|
|
||||||
|
def pre_build():
|
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r_pre_build(
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|
_G,
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|
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|
)
|
||||||
|
|
||||||
|
def post_build():
|
||||||
|
git_pkgbuild_commit()
|
||||||
|
update_aur_repo()
|
29
BioArchLinux/r-ggstatsplot/lilac.yaml
Normal file
29
BioArchLinux/r-ggstatsplot/lilac.yaml
Normal file
|
@ -0,0 +1,29 @@
|
||||||
|
build_prefix: extra-x86_64
|
||||||
|
maintainers:
|
||||||
|
- github: pekkarr
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||||||
|
email: pekkarr@protonmail.com
|
||||||
|
repo_depends:
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||||||
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- r-correlation
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||||||
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- r-datawizard
|
||||||
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- r-dplyr
|
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|
- r-ggcorrplot
|
||||||
|
- r-ggplot2
|
||||||
|
- r-ggrepel
|
||||||
|
- r-ggside
|
||||||
|
- r-ggsignif
|
||||||
|
- r-glue
|
||||||
|
- r-insight
|
||||||
|
- r-paletteer
|
||||||
|
- r-parameters
|
||||||
|
- r-patchwork
|
||||||
|
- r-performance
|
||||||
|
- r-purrr
|
||||||
|
- r-rlang
|
||||||
|
- r-statsexpressions
|
||||||
|
- r-tidyr
|
||||||
|
update_on:
|
||||||
|
- source: rpkgs
|
||||||
|
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|
||||||
|
repo: cran
|
||||||
|
md5: true
|
||||||
|
- alias: r
|
59
BioArchLinux/r-statsexpressions/PKGBUILD
Normal file
59
BioArchLinux/r-statsexpressions/PKGBUILD
Normal file
|
@ -0,0 +1,59 @@
|
||||||
|
# Maintainer: Pekka Ristola <pekkarr [at] protonmail [dot] com>
|
||||||
|
|
||||||
|
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|
||||||
|
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|
||||||
|
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|
||||||
|
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|
||||||
|
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|
||||||
|
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|
||||||
|
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|
||||||
|
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|
||||||
|
license=('MIT')
|
||||||
|
depends=(
|
||||||
|
r-afex
|
||||||
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r-bayesfactor
|
||||||
|
r-bayestestr
|
||||||
|
r-correlation
|
||||||
|
r-datawizard
|
||||||
|
r-dplyr
|
||||||
|
r-effectsize
|
||||||
|
r-glue
|
||||||
|
r-insight
|
||||||
|
r-magrittr
|
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|
r-parameters
|
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|
r-performance
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|
r-pmcmrplus
|
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|
r-purrr
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|
r-rlang
|
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|
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|
||||||
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r-tidyr
|
||||||
|
r-withr
|
||||||
|
r-wrs2
|
||||||
|
r-zeallot
|
||||||
|
)
|
||||||
|
optdepends=(
|
||||||
|
r-ggplot2
|
||||||
|
r-knitr
|
||||||
|
r-metabma
|
||||||
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r-metafor
|
||||||
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r-metaplus
|
||||||
|
r-patrick
|
||||||
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r-rmarkdown
|
||||||
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r-testthat
|
||||||
|
)
|
||||||
|
source=("https://cran.r-project.org/src/contrib/${_pkgname}_${_pkgver}.tar.gz")
|
||||||
|
md5sums=('5dd904c3c2c04090a5dc35288289f352')
|
||||||
|
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|
||||||
|
|
||||||
|
build() {
|
||||||
|
mkdir build
|
||||||
|
R CMD INSTALL -l build "$_pkgname"
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
||||||
|
package() {
|
||||||
|
install -d "$pkgdir/usr/lib/R/library"
|
||||||
|
cp -a --no-preserve=ownership "build/$_pkgname" "$pkgdir/usr/lib/R/library"
|
||||||
|
|
||||||
|
install -d "$pkgdir/usr/share/licenses/$pkgname"
|
||||||
|
ln -s "/usr/lib/R/library/$_pkgname/LICENSE" "$pkgdir/usr/share/licenses/$pkgname"
|
||||||
|
}
|
14
BioArchLinux/r-statsexpressions/lilac.py
Normal file
14
BioArchLinux/r-statsexpressions/lilac.py
Normal file
|
@ -0,0 +1,14 @@
|
||||||
|
#!/usr/bin/env python3
|
||||||
|
from lilaclib import *
|
||||||
|
|
||||||
|
import os
|
||||||
|
import sys
|
||||||
|
sys.path.append(os.path.normpath(f'{__file__}/../../../lilac-extensions'))
|
||||||
|
from lilac_r_utils import r_pre_build
|
||||||
|
|
||||||
|
def pre_build():
|
||||||
|
r_pre_build(_G)
|
||||||
|
|
||||||
|
def post_build():
|
||||||
|
git_pkgbuild_commit()
|
||||||
|
update_aur_repo()
|
31
BioArchLinux/r-statsexpressions/lilac.yaml
Normal file
31
BioArchLinux/r-statsexpressions/lilac.yaml
Normal file
|
@ -0,0 +1,31 @@
|
||||||
|
build_prefix: extra-x86_64
|
||||||
|
maintainers:
|
||||||
|
- github: pekkarr
|
||||||
|
email: pekkarr@protonmail.com
|
||||||
|
repo_depends:
|
||||||
|
- r-afex
|
||||||
|
- r-bayesfactor
|
||||||
|
- r-bayestestr
|
||||||
|
- r-correlation
|
||||||
|
- r-datawizard
|
||||||
|
- r-dplyr
|
||||||
|
- r-effectsize
|
||||||
|
- r-glue
|
||||||
|
- r-insight
|
||||||
|
- r-magrittr
|
||||||
|
- r-parameters
|
||||||
|
- r-performance
|
||||||
|
- r-pmcmrplus
|
||||||
|
- r-purrr
|
||||||
|
- r-rlang
|
||||||
|
- r-rstantools
|
||||||
|
- r-tidyr
|
||||||
|
- r-withr
|
||||||
|
- r-wrs2
|
||||||
|
- r-zeallot
|
||||||
|
update_on:
|
||||||
|
- source: rpkgs
|
||||||
|
pkgname: statsExpressions
|
||||||
|
repo: cran
|
||||||
|
md5: true
|
||||||
|
- alias: r
|
36
BioArchLinux/r-wrs2/PKGBUILD
Normal file
36
BioArchLinux/r-wrs2/PKGBUILD
Normal file
|
@ -0,0 +1,36 @@
|
||||||
|
# Maintainer: Pekka Ristola <pekkarr [at] protonmail [dot] com>
|
||||||
|
|
||||||
|
_pkgname=WRS2
|
||||||
|
_pkgver=1.1-6
|
||||||
|
pkgname=r-${_pkgname,,}
|
||||||
|
pkgver=${_pkgver//-/.}
|
||||||
|
pkgrel=1
|
||||||
|
pkgdesc="A Collection of Robust Statistical Methods"
|
||||||
|
arch=(any)
|
||||||
|
url="https://cran.r-project.org/package=$_pkgname"
|
||||||
|
license=('GPL-3.0-only')
|
||||||
|
depends=(
|
||||||
|
r-plyr
|
||||||
|
r-reshape
|
||||||
|
)
|
||||||
|
optdepends=(
|
||||||
|
r-car
|
||||||
|
r-colorspace
|
||||||
|
r-ggally
|
||||||
|
r-ggplot2
|
||||||
|
r-knitr
|
||||||
|
r-mediation
|
||||||
|
)
|
||||||
|
source=("https://cran.r-project.org/src/contrib/${_pkgname}_${_pkgver}.tar.gz")
|
||||||
|
md5sums=('1d680b11b9cdc32bfd9ea886b0754904')
|
||||||
|
b2sums=('3c24050f90afa84677d2755e46c478dab6c3319a376ad8bb2fdbebc568cf449adecdc0cb2974b9390f70a1a7e64aa55aed9a9dba12155e902f879f24988604cc')
|
||||||
|
|
||||||
|
build() {
|
||||||
|
mkdir build
|
||||||
|
R CMD INSTALL -l build "$_pkgname"
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
||||||
|
package() {
|
||||||
|
install -d "$pkgdir/usr/lib/R/library"
|
||||||
|
cp -a --no-preserve=ownership "build/$_pkgname" "$pkgdir/usr/lib/R/library"
|
||||||
|
}
|
17
BioArchLinux/r-wrs2/lilac.py
Normal file
17
BioArchLinux/r-wrs2/lilac.py
Normal file
|
@ -0,0 +1,17 @@
|
||||||
|
#!/usr/bin/env python3
|
||||||
|
from lilaclib import *
|
||||||
|
|
||||||
|
import os
|
||||||
|
import sys
|
||||||
|
sys.path.append(os.path.normpath(f'{__file__}/../../../lilac-extensions'))
|
||||||
|
from lilac_r_utils import r_pre_build
|
||||||
|
|
||||||
|
def pre_build():
|
||||||
|
r_pre_build(
|
||||||
|
_G,
|
||||||
|
expect_needscompilation = True,
|
||||||
|
)
|
||||||
|
|
||||||
|
def post_build():
|
||||||
|
git_pkgbuild_commit()
|
||||||
|
update_aur_repo()
|
13
BioArchLinux/r-wrs2/lilac.yaml
Normal file
13
BioArchLinux/r-wrs2/lilac.yaml
Normal file
|
@ -0,0 +1,13 @@
|
||||||
|
build_prefix: extra-x86_64
|
||||||
|
maintainers:
|
||||||
|
- github: pekkarr
|
||||||
|
email: pekkarr@protonmail.com
|
||||||
|
repo_depends:
|
||||||
|
- r-plyr
|
||||||
|
- r-reshape
|
||||||
|
update_on:
|
||||||
|
- source: rpkgs
|
||||||
|
pkgname: WRS2
|
||||||
|
repo: cran
|
||||||
|
md5: true
|
||||||
|
- alias: r
|
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